该剧是以单元的剧式对狄仁杰侦破案件的故事进行全新的揭秘与解读，讲述了破获以情花案和金人案为代表的一连串谜案的故事。唐武周时代的一年春天，扬州琼花观天下独有的琼花突然枯而复荣，而且竟然绽放出血色花朵，一时间人心惶惶，谣诼纷起，且矛头直指国体，威胁到朝政安全。为此，大周皇帝武则天特派太子李旦前往镇抚，不料李旦却于抵达扬州后…

一场天灾浩劫，紫魔兰在人类居住的山谷肆意滋长，它能够使人沉沦直至失去生命，只有花千谷由于花神树的镇守而幸免于难。但神兽凤凰从山谷外带来的紫魔兰毒浸染的婴儿打破了花千古的平静。花千谷的国王和王后违背了花千谷不让外人进入的祖训收留了这个婴儿，取名牡丹公主，抚养她茁壮成长。花神树突然凋谢，牡丹公主一病不起，让花千谷上下疑窦众…