来自英国、中国、美国等五个国家的六个孩子来到了小丸子（Tarako 配音）的家乡清水市。来自意大利的安德烈（中川大志 Taishi Nakagawa 配音）暂住在了小丸子的家里。小丸子他们和外国小朋友们一起在学校里上课，还利用周末一起前往大阪和京都去旅行。一开始，小丸子因安德烈太过热情而感到困扰，但是知道了他来日本的理由后便开始和他和睦相处了…

在绿意盎然的边境小村住着一个吃货少女，她的名字叫做琳。而豪华的王都则有一个名叫菲妮斯的歌姬，孤独地居住在王宫深处。她们两人都拥有着特别的力量，那就是通过唱歌能够引发包括治愈伤口、生出水源、起风等奇迹般的现象，而命运却将这两人引导向一条残酷的旅途.......

　　千年一次的彗星之夜里，愿望将会实现……　　立志成为出色的神奇宝贝训练师的小智、小遥和小胜，带着皮卡丘展开了新的旅程。为了观看千年彗星出现的刹那，来到恩斯游乐场，并认识魔术师巴特勒与戴安。在魔术表演中，小胜听到一阵细微的呼唤声…　　那是在〝沉眠之茧〞中沉睡了千年，可帮助人类达成愿望的神奇宝贝——基拉祈。在千年彗星出现…

木木川是一个拥有非人类般强大战斗力的“暴力少年”。一个意外事件，让原本生活在另外一个世界空间的木木川来到了地球。在适应地球生活的过程中，他结识了一帮坚持梦想的朋友：个头虽小,但充满勇气、坚守正义,梦想成为漫画家的信一；曾经走上歧路,但因为热爱音乐而重新找回人生目标的向冰，以及其他性格鲜明的热血少年。木木川和他们一起不断的…

每集一个精彩的反转悬疑故事。

在宇宙星际空间，一日，木木豆的父亲木森突然失踪了，留下一封信，让木木星好好管理四人侦探事务所，于是木木星开始了重振事务所的故事。

以木木豆为首的四位小侦探与神秘组织斗智斗勇，顺着父亲留下的笔记为线索，前往各个星球搜寻神秘组织的珠子马迹，沿途成功破获各种离奇案件，最后协助宇宙安全局成功搞毁神秘组织。