丹尼斯的双亲是未受到社会支持的疯狂科学家。他们将自己的孩子监禁在孤岛的研究所，进行秘密实验，将除丹尼斯以外的一个哥哥和三个姐姐改造成了特异的人类。 某天，父母被警察拘捕、孩子们则在社工安排下到另一个小岛上居住。问题是，除主人公以外的四名兄姐， 没有一人拥有现代人的常识……

位于一个普通城市里，一班普通的男子高中学过着普遍的日常生活。想像机动战士和冒险故事，放学後交女朋友的方法，对女生的裙子充满幻想，在家讲恐怖鬼故事，与女生同行被误会，以及遇上文学少女的小插曲，述说一切男子高中生的日常生活。

故事背景设定为20世纪90年代的半架空世界，国际佣兵化军事组织“秘银”与国际恐怖组织展开着战斗，而在这过程中身为秘银特工的少年相良宗介，与他任务中的保护对象——高中生少女千鸟要相遇并展开了一段冒险之旅。

故事讲述一个自幼丧母的少年小杰，为了寻找失散多年的父亲，以及成为一个和父亲一样出色的“猎人”，踏上了崎岖而漫长的旅程，接受重重测试，途中遇上各色各样的同伴和敌人，各自为了不同的目的而展开一场又一场的战斗……在《全职猎人》的世界里猎人是个很受人尊敬的职业，亦引得无数人来参加猎人的测试，小杰在众考生中脱颍而出通过了猎人种种…