2149年，由于过度开发和过分的污染，地球的生态环境越来越差

全人类被神奇的现象一瞬间石化后过了几千年——拥有超人般头脑、天生的科学少年·千空苏醒了。在文明遭到毁灭的石之世界（STONE WORLD）里，千空决定要用科学的力量复原整个世界。而与此同时苏醒过来的有，以有着过人体力的儿时玩伴·大木大树为首的伙伴们，从零开始创造文明——从石器时代到现代文明，绝对要赶上这科学史的200万年差距！前所未…

全人类被神奇的现象一瞬间石化后过了几千年——拥有超人般头脑、天生的科学少年·千空苏醒了。在文明遭到毁灭的石头世界（STONE WORLD）里，千空决定要用科学的力量复原整个世界。而与此同时苏醒过来的有，以有着过人体力的儿时玩伴·大木大树为首的伙伴们，从零开始创造文明——从石器时代到现代文明，一定要赶上这科学史的200万年差距！前所未…

架空新大陆上，出现了一名跋涉中的龙族少女，操控特殊元素为武力的她，身体内存在一种神秘的力量——阳炎之息。这种力量不仅让她的寿命仅仅剩下两年，自己唯一的亲人也因为自己的阳炎之息疾病缠身！为了改变命运，她毅然踏上征程。路途凶险，此去经年，一路上究竟会发生什么呢？

还没有见过的神奇宝贝…还没有见过的城镇……为了见到未知的事物，小智与皮卡丘到了全新的冒险之地──合众地方！正为了在新天地的冒险雀跃不已时，眼前出现了这地方的神奇宝贝研究权威、红豆杉博士！大家立刻前往研究所，此时，天上突然出现黑云、雷鸣大作。在那中心，有像是黑色巨大神奇宝贝的影子。下一秒，影子放出的雷电直接击中小智的皮卡…

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身经百战的超级英雄们产生了职业倦怠，已经卸下钢铁战甲的托尼·斯塔克因此发明了“奥创”——一个有自我意识、有学习能力的人工智能机器人，并将指挥机器人军团的重任交给奥创。

特别篇主要讲述了千空航海前与龙水打交道的故事。为了换取龙水的航海技术，千空他们要在这个史前社会挖石油……