讲述了以全国高中生麻将大会冠军为目标的清澄高中麻将部以及咲在麻将竞技比赛中激烈夺冠的故事。

故事背景设定在《天才麻将少女》本篇第二主角原村和曾生活的奈良县，主角校为阿知贺女子学院。 原村和在初中阶段曾经在阿知贺女子学院读书，由于人数不足，麻将部一度处于废部的境地，而麻将部的活动室则被当做当地儿童麻将活动室，今年由于人数足够，麻将部重新开始活动，围绕原村和展开的麻将竞技故事由此开始。

故事讲述天才麻将少女宫永咲虽然还是一位刚升入高中一年级的学生，便能以正负0分的方式打完牌局从而创下赫赫威名。故事二号女主角原村和则是在全国中学生麻将大赛个人组中夺得冠军的少女，两人因缘而聚到了麻将部，并以高中校际比赛的顶点为目标展开一段麻将竞技之旅。

　　不幸的少年，高中生绫崎飒，为浪费无度的父母而被迫辛苦打工，怎知道借了1亿5000万日元高利贷的父母却逃之夭夭，用绫崎飒本人抵债。　　为了偿还高额巨债与逃避高利贷的追杀，绫崎飒选择诱拐一名少女。但阴差阳错，他却成了将这名少女从绑匪手中拯救出来的英雄。　　深受感动的少女表明身份，原来她是大富翁家的大小姐三千院凪。凪不仅帮绫…

　　霧の総旗艦・ヤマトを目指していたイ401の艦長・千早群像は、父、翔像の生存を知ると、父との再会という新たな目的を抱き北極海へと向かう。一方、メンタルモデルとして成長してきたイオナは、自らの出自を告げられたことでその過去に苦しめられてしまう。

　　在老家的餐饮店“幸平餐馆”一边帮忙下厨一边磨炼厨艺的幸平创真，前往超级精英料理学校“远月茶寮料理学园”入学。幸平创真在学园中与各式各样的料理人相遇并不断成长着，同时也开始摸索“只属于自己的料理”。　　幸平创真在真实餐厅学习的“在职料理课程”中进一步积累了经验，突破了以往的自己，习得了新的料理，成功完成了课程并且迎来…

　　故事发生在遥远的未来世界之中，地球上存在一种身体由宝石形成的宝石人形生命体，这种生命体自打一出现以来就经历着遭人掠夺的悲惨命运，如今，全世界仅剩下28人。来历不明的神秘种族“月人”出现开始掠夺宝石人，将他们残忍的制作成装饰品，不仅如此，甚至将他们加工成为武器。　　十分易碎又没有韧性的磷叶石（黑泽朋世 配音）、能够释放…

高岭清麿由于智力超群而被中学的同学们疏远，为此他自暴自弃的不愿意上学。某天一个叫卡修的奇怪小孩来到他家，自称清麿之父是自己的救命恩人，为了报恩他来到日本帮助和教导清麿。远在英国的父亲寄来的信中曾说卡修失去了记忆，而他随身携带的一本红色书籍似乎和其身世有关。那本写满奇怪文字的书连博学的父亲也无法理解，但是清麿却发现自己竟…

在“超高校级的绝望”带来的“人类史上最大最恶的绝望事件”之下，世界陷入了濒临崩坏的绝境。为了拯救这个充满绝望的世界，“未来机关”结成了。打倒了江之岛盾子的苗木诚等78期生，加入了未来机关。他们在此继续复兴世界的活动，但苗木却被问以庇护“绝望的残党”这一叛逆之罪。未来机关众人为了苗木的处分而聚集在一起，却遭到黑白熊的监禁，…