身份不明的游戏病毒生命体来袭，人类将陷入前所未闻的危机。以恐怖的趋势扩大感染中，天空寺尊（假面骑士灵骑）也因为感染上这种病毒，失去了变身的能力。另一方面宝生永梦（假面骑士艾克赛德）追查敌人的真面目及感染源，但那正左右他自身的命运的“重大的真实”有着连系关系。被堵住去路的艾克赛德与灵骑。谁能在这穷途末路的危机下拯救这两名…

野宫透的生活平淡无波，在还没有经历过动人心魄的青春恋情的情况下就要这样长大成人了。在他失落之时，他与以前组乐队时的好友龙也重逢了，给他的生活带来了变化。不仅如此，他还在机缘巧合之下，读到了一首直击他内心的诗，使他鼓起了追求爱情的勇气。以这首诗为线索，他最终遇到了他的真命天女：诗的作者伊藤凪。但凪此时已不再作诗，而且她还…